生物有机肥成套设备厂的设计过程中，对环境公害问题制定恰当的控制方法是很重要的。生物有机肥成套设备加工厂主要的公害是具气和蚊蝴。生物有机肥成套设备加工过程中，应选择合适的厂址以及根据周围环境的需要选择合适的有机肥料加工方式。

1. 生物有机肥成套设备恶臭的控制：畜食类便、作物精秆等有机物料是有机肥料加工的主要原料，这些原料都不可避免地会产生一些思臭，建立新的有机肥料厂时，应考虑臭气控制情况。首先应注意厂址的选择。厂址应距高居民集中区有一定距离.绝对不能建在居民生活区和工业区的中间。其次许多技术均可用以减少有机原料发解过程中恶臭的浓度。目前脱臭方法主要有液体洗涤、吸附等技术。

(1)液体洗涤，将生物有机肥成套设备加工过程中产生的恶臭气体通过液体,使气体溶解于液体之中。最普通的溶剂是水，结合采用化学氧化剂如高锰酸钾、次氨酸钠、氢氧化钙或氢氧化钠以及各种酸，效果更好。

(2)吸附法吸附是恶臭气体与强吸附性物质接触，这些物质可吸附并减少恶臭气体。在有机肥料发酵原料中拌人一定比例的佛石、草炭，发酵过程中产生的氨气、硫化氢等恶臭气体就会被这些物质吸附，既减少了恶臭气体，还可减少有机原料养分的损失。让恶臭气体流过吸附能力强的物质层，利用吸附物质的强吸附性，除掉恶臭气体。构成恶臭气体的成分无论是无机的还是有机的物质，活性炭都能有效地进行处理,它是一种很好的吸附物质。价格低廉的吸附物质还有碎木屑等。