有机肥生产全套设备一般而言，大多数有机肥均有肥效缓慢的特点，对土壤微生态的调控滞后,因而达不到最佳防效。对此有机肥生产全套设备可采用调节施肥期和调节发酵腐熟度两个方法加以调节。

有机肥生产全套设备调节施肥期提前施基肥和提早追肥则能较好地解决此矛盾，充分发挥其肥效和防效的潜力。对于同一肥料,采取不同追肥时间，其对土壤微生物多样性的影响以及防治土传病害的效果均不同。追肥及时，土壤微生物多样性指数维持较高,其发病率最低;而追肥时间迟，致使前期土壤微生物多样性指数较低，即使后期显著提高，也难以抑制病菌的繁殖，其发病率则较高。

因此，适时追肥，及时调控土壤微生态是防病肥发挥功效，实现“施肥防病”的关键。