小型生物有机肥设备发酵腐熟菌种腐熟的有机物料，不能直接用来制作生物有机肥料。小型生物有机肥设备未经发酵腐熟的有机物料制作的有机肥料，经不起不起用户和市场的考验。常用的有机物料有:

(1) 小型生物有机肥设备粪便类鸡粪、猪炎、牛粪、羊粪、马粪等动物粪便:

(2) 小型生物有机肥设备秸秆类玉米秸秆、稻草、麦秸、豆秸等农作物秸秆等;

(3)颗粒类稻壳、稻壳粉、花生壳粉、花生秧粉、谷糖、苗糠等；

(4)精渣类酒精、酱油柳、醋柳、排醛渣、术糖清、木薯渣、酶渣、大蒜渣、糖渣等:

(5)饼粕类豆饼、豆柏、油枯、菜籽饼等:

(6)其他生活污泥、糖厂滤泥、糖泥、旅渣等。

小型生物有机肥设备这些原料用有机物料发酵菌种发酵后，都可以作为生物有机肥制作的辅助营养料。需要说明的是，在制作生物有机肥时，这些发酵原料不必达到有机肥中所要求总养分的标准。