生物有机肥发酵设备原料颗粒的大小与通气状况相关。生物有机肥发酵设备颗粒大小不同，发酵反应速度和发酵时间长短有所不同。不是颗粒越小越好，也不是颗粒越大越有利。

生物有机肥发酵设备一般秸秆类发酵，颗粒或者长度可以稍大，3~5厘米也可以发酵。粪便污泥等，由于质地较细，所以为了增加大颗粒物质，需要适当添加秸秆类物质。

生物有机肥发酵设备各种原料发酵生产有机肥料的基础配方举例(本配方表没有特别说明，都是按质量百分比计。)：糠醛渣:70 %、炉灰渣:5%、畜禽粪便:20 %、褐煤:5%、有机肥发酵菌种 :0. 1%。