现有国内外年产5000吨有机肥设备的质量评价多集中在营养方面，尚未有考虑其土壤微生态调控作用及年产5000吨有机肥设备相应的质量评价指标。

已有的研究表明,用BIOLOG方法可以衡量有机肥对土壤微生物多样性的影响，而多样性指标提高与防病效果密切相关。因此，BIOLOG测定有可能成为评价防病肥防效的一个重要指标。菌量是评价生物有机肥质量的一个重要指标,这仅是在施用前的指标，而施用后能否在土壤中快速繁殖形成对病菌的优势菌群，对于防病效果至关重要，但这却被忽略了。目前尚无评价方法 , 年产5000吨有机肥设备今后应当加强。